Oorspronkelijk richtte de in 1988 opgezette luchtvaartmaatschappij zich op het uitvoeren van regionale vluchten tussen de verschillende eilanden binnen de archipel. In 2005 werden er voor het eerst vluchten opgezet naar het buitenland, en in de loop der jaren kwamen er lijndiensten naar Portugal, Madeira, Marokko (inclusief de betwiste westelijke Sahara), Senegal, Mauritanië, Gambia en Kaapverdië.

In 2018 besloot Binter reguliere vluchten naar het Spaanse vasteland te beginnen. Daardoor worden sindsdien Pamplona, Vigo, Zaragoza, Murcia, Santander, Vitoria, Asturia en Cadiz aangevlogen, evenals het eiland Mallorca. In 2021 werd er gestart met vluchten naar Tarragona.

Binter vloog voorheen uitsluitend met ATR 72 turboprops en enkele van Air Nostrum gehuurde Bombardier CRJ’s. In 2019 was de Spaanse luchtvaartmaatschappij de eerste Europese gebruiker van de Embraer 195-E2, waarvan er vijf werden besteld.

De E2 maakt het mogelijk om op een comfortabele manier verderop gelegen bestemmingen met de Canarische Eilanden te verbinden. Deze zomer worden er lijndiensten gestart naar Lille, Marseille en Toulouse in Frankrijk en naar Turijn en Venetië in Italië. “Een belangrijke beslissing, die het toerisme naar de Canarische Eilanden zal stimuleren”, aldus topman Ángel Víctor Torres.