Op 20 maart 2004 vertrok de eerste vlucht van Jetairfly met 189 passagiers aan boord van Brussels Airport naar Spanje. De luchtvaartmaatschappij werd oorspronkelijk opgericht om vakantiegangers van touroperators TUI (destijds Jetair), VIP Selection en Sunjets naar hun vakantiebestemming te vervoeren.

In 2004 deed TUI fly Belgium 42 bestemmingen aan, voornamelijk in het Middellandse Zeegebied. Al snel werden de activiteiten uitgebreid en konden reizigers naast pakketreizen ook enkel de vlucht boeken of naar verder gelegen bestemmingen vliegen. Een jaar later was TUI fly Belgium de eerste Belgische maatschappij die rechtstreekse vluchten naar het Caribisch Gebied aanbood. Vandaag de dag worden momenteel een honderdtal bestemmingen aangeboden vanuit België.

Bij de start vloog Jetairfly met vijf Boeing 737’s. Inmiddels is de vloot gegroeid naar 17 Boeing 737’s, drie Embraer 190-E2’s en een Boeing 787-8 Dreamliner.

Binnen de TUI Airline-groep, waaronder ook TUI fly Nederland valt, had TUI fly Belgium door de jaren heen verschillende primeurs. Zo was de Belgische divisie de eerste die met de Boeing 737 MAX, 787 Dreamliner en Embraer 190 en later 190-E2 ging vliegen.

TUI fly Belgium vliegt niet alleen vanaf Brussel, maar biedt ook vluchten aan van en naar Antwerpen, Luik en Oostende. Doordat de Belgische en Nederlandse divisie onder dezelfde organisatie vallen, zijn Belgisch geregistreerde TUI-vliegtuigen ook geregeld op Nederlandse luchthavens te zien op vluchten van TUI Nederland.